Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms