Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
VPS72Q15906 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms