Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VAMP3Q15836 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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