Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SP140Q13342 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SP140Q13342 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SP140Q13342 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SP140Q13342 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SP140Q13342 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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