Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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SGCGQ13326 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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SGCGQ13326 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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SGCGQ13326 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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SGCGQ13326 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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SGCGQ13326 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SGCGQ13326 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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