Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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NRF1Q16656 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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NRF1Q16656 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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NRF1Q16656 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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NRF1Q16656 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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NRF1Q16656 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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NRF1Q16656 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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NRF1Q16656 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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NRF1Q16656 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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NRF1Q16656 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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NRF1Q16656 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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NRF1Q16656 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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