Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NRF1Q16656 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms