Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit3W8DXL4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit3W8DXL4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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