Protein–RNA interactions for Protein: V9GXR0

H2-Bl, Histocompatibility 2, blastocyst, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-BlV9GXR0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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H2-BlV9GXR0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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H2-BlV9GXR0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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H2-BlV9GXR0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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H2-BlV9GXR0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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H2-BlV9GXR0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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H2-BlV9GXR0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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