Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vstm4T1NXB5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm4T1NXB5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms