Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hdac5Q9Z2V6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac5Q9Z2V6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms