Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ubl3Q9Z2M6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ubl3Q9Z2M6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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