Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms