Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gipc2Q9Z2H7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms