Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn7Q9Z261 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms