Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clic1Q9Z1Q5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clic1Q9Z1Q5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clic1Q9Z1Q5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clic1Q9Z1Q5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms