Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms