Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms