Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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AireQ9Z0E3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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AireQ9Z0E3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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AireQ9Z0E3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AireQ9Z0E3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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