Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap4s1Q9WVL1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap4s1Q9WVL1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms