Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pacsin2Q9WVE8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pacsin2Q9WVE8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms