Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clcn5Q9WVD4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clcn5Q9WVD4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms