Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katna1Q9WV86 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katna1Q9WV86 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1007.5 ms