Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VapaQ9WV55 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VapaQ9WV55 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VapaQ9WV55 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VapaQ9WV55 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VapaQ9WV55 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VapaQ9WV55 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapaQ9WV55 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapaQ9WV55 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapaQ9WV55 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapaQ9WV55 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapaQ9WV55 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapaQ9WV55 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapaQ9WV55 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapaQ9WV55 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapaQ9WV55 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapaQ9WV55 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VapaQ9WV55 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms