Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrf1Q9WU00 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms