Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skp1Q9WTX5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms