Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh13Q9WTR5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh13Q9WTR5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms