Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax2Q9WTP9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax2Q9WTP9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax2Q9WTP9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax2Q9WTP9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vax2Q9WTP9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms