Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms