Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1Q9R1Q9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp6ap1Q9R1Q9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms