Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psma1Q9R1P4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms