Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slit2Q9R1B9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms