Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfwd2Q9R1A8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms