Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Plod1Q9R0E2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms