Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Plod3Q9R0E1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms