Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek3Q9R0A5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms