Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtsjQ9R014 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtsjQ9R014 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms