Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a4Q9QZR9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col4a4Q9QZR9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms