Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copg1Q9QZE5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms