Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms