Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp3Q9QY23 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp3Q9QY23 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms