Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms