Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcsk1nQ9QXV0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms