Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trip4Q9QXN3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip4Q9QXN3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms