Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Limd1Q9QXD8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms