Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc2lQ9JME7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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