Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3b2Q9JME5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap3b2Q9JME5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap3b2Q9JME5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap3b2Q9JME5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap3b2Q9JME5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap3b2Q9JME5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap3b2Q9JME5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b2Q9JME5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b2Q9JME5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b2Q9JME5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3b2Q9JME5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms