Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Prg4Q9JM99 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Prg4Q9JM99 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Prg4Q9JM99 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Prg4Q9JM99 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Prg4Q9JM99 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Prg4Q9JM99 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Prg4Q9JM99 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Prg4Q9JM99 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Prg4Q9JM99 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg4Q9JM99 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms