Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rabgef1Q9JM13 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms