Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l2Q9JLG4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms